区政协内设两室五个专门委员会（办公室、研究室、提案和委员工作委员会、经济科技和农业农村委员会、教文卫体和文史委员会、环境资源和城乡建设委员会、社法民宗和港澳台侨委员会）。同时，在十个镇（街道）和滨开区设立政协组织：滨开区政协工作联络处、孟河镇政协工作委员会、薛家镇政协工作委员会、罗溪镇政协工作委员会、西夏墅镇政协工作委员会、奔牛镇政协工作委员会、新桥街道政协工作委员会、三井街道政协工作委员会、龙虎塘街道政协工作委员会、春江街道政协工作委员会、魏村街道政协工作委员会。

其中：办公室、研究室为政协机关内设的办事机构，处理政协日常事务。提案和委员工作委员会，负责处理委员提案的组织、征集、交办及社情民意工作，还有委员的学习培训、管理考核、联络服务。经济科技和农业农村委员会，负责联系全区经济、农业、科技、工商联等相关界别的委员和人士，围绕经济发展、科技创新、结构调整等方面的重大事项，组织开展座谈讨论、专题协商、视察调研等活动。教文卫体和文史委员会，组织相关界别委员围绕卫生、文化教育、社会福利与保障等社会事业的发展规划、重大决策、重要举措及民主法制建设、社会管理创新等人民群众普遍关心的热点、难点问题，开展座谈讨论、专题协商、视察调研等活动。环境资源和城乡建设委员会，组织相关界别委员围绕环境保护、城市建设管理、资源利用等方面的重大事项，组织开展座谈讨论、专题协商、视察调研等活动。社法民宗和港澳台侨委员会，负责联系全区各民主党派、无党派代表人士、工会、共青团（青联）、妇联、侨联、台联、少数民族和宗教界等相关界别的委员和人士，围绕全区经济社会发展的重大事项和重点问题，开展座谈讨论、专题协商、视察调研等活动。

滨开区及各镇、街道政协工作委员会负责区政协在镇、街道的工作联络，组织本区域内政协委员开展履职活动。